DIA/SWATCH

DIA（data-independent acquisition）指数据非依赖型扫描模式，不同于传统的DDA（数据依赖型扫描模式），DIA技术将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口，高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测，而非根据母离子信号强度筛选后进行二级碎片再扫描。

DIA技术较传统的DDA（iTRAQ/TMT/Labelfree）蛋白组技术而言，具有以下优势：

• 重现性好：采集所有离子及碎片谱图，保证了数据的完整性，缺失值少。

• 选择性好：基于碎片离子（即母子离子对）定量，与 SRM/MRM 相当。

• 准确度高：循环时间固定，扫描点数均匀，定量准确度高。

• 通量高：克服了iTRAQ/TMT的通量低的限制。

• 时效性强：对于易降解样品可以即刻采集，获得数据后再深入挖掘。

• 检出率高：提高了低丰度蛋白的检出率。

• 耗时短：样本无需分级上机，极大的缩短了每个样品的检测时间。

因此，DIA技术更适合于大样本量、复杂体系的蛋白质组研究。但由于DIA获得的是几乎没有任何丢失的所有离子信息，数据量及复杂性增加，导致数据分析难度也大大增加。

图1. DDA和DIA方法的比较（A-E:DDA，F-J:DIA）

SWATH（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Spectra）是一种特定的DIA方法，由AB SCIEX公司开发，使用Triple-TOF系列质谱仪实现。该技术采用多个子窗口来覆盖整个质谱范围，并且每个子窗口内都有一定数量的离子片段。与DIA不同的是，SWATH在每个子窗口内仅采集指定离子的质谱信号，而不是记录每一个离子的信号。这样可以在获得高离子片段覆盖率的同时，减少复杂性和混杂性，提高定量的准确性和可重复性。

百泰派克公司采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨质谱系统，具有快速扫描速度和串联四极杆质谱系统的定量灵敏度，集质谱系统的高分辨、准确质量数稳定性、高灵敏度和高速度扫描特点于一身，推出SWATH定量蛋白组分析服务技术包裹，您只需要将您的样品寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

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