人肿瘤circRNA PCR芯片
- 上海启因生物科技有限公司2019年3月29日 1:46 点击：3415
PCR ARRAY介绍
PCR ARRAY又称PCR芯片，运用高通量荧光定量PCR方法，在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或疾病相关基因的表达量变化进行检测，芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因或者待考证的基因；目前启因生物针对不同的信号通路和疾病相关基因设计了150多款功能分类PCR芯片，涵盖生命科学研究的各个领域。
人肿瘤circRNA PCR芯片介绍
circRNA 与肿瘤 TNM 分型密切相关。circRNA 通过调控大量信号通路与肿瘤细胞的增殖、凋亡以及转移密切关联，另外还能通过细胞外囊泡（e.g. 外泌体，纳米微粒）进行转运，并且circRNA 具有低分子量、较好的稳定性与保守性的特点，因此，circRNA 具有作为治疗肿瘤的药物靶点或载体的潜能。启因生物的人肿瘤circRNA PCR ARRAY含有94个人肿瘤circRNA 相关基因，包含乳腺癌，食管癌，非小细胞肺癌，肝癌，胃癌，膀胱癌，骨肉瘤，胶质瘤等数十种肿瘤或癌症类型。
产品说明
产品名称 | 人肿瘤circRNA PCR芯片 |
货 号 | sp-TWCPAHM-0012 |
基因数目 | 94个 |
基因名称 | 见基因列表 |
检测费用 | 1000元/样 |
样本类型 | 细胞，组织等 |
项目周期 | 2周（不含节假日） |
实验结果 | 原始数据，数据分析 |
技术原理 | *相对定量，SYBR Green法 |
*相对定量：用于测定一个测试样本中目标基因与校正样本中同一基因表达的相对变化。校正样本可以是一个未经处理的对照或者是在一个实验研究中处于零时的样本。
服务特点
1. 只需提供样品
2. 数据分析多样性选择
3. 中低通量，一次性检测多个相关基因的表达水平
4. 周期短
5. 结果不需要qPCR验证
服务流程
1. 确定实验方案，签合同
2. 样品寄出（-80℃顺丰寄出）
3. 收样后进行质控
4. 质控过关，上机检测
5. 数据分析
样品预处理方法
为了避免样品中RNA降解，需对样品进行预处理。
样品类型 | 处理方法 | 送样量 |
贴壁细胞 | ①倒出培养液，用 1×PBS 清洗一次。 | 至少1×106个细胞 |
悬浮细胞 | ①将悬浮培养细胞连同培养液一起倒入离心管中，8,000 g 4℃离心2 分钟，弃上清。 | 至少1×106个细胞 |
组织（动物器官类） | 离心管中加1 ml 的 trizol，确保浸没组织，-80℃保存 | 至少20mg,约小黄豆大小 |
检测流程：
1. 样品总RNA提取
2. RNA质量检测，检测RNA纯度及完整度，提供RNA质量报告；
3. cDNA合成，使用逆转录酶，将样品RNA逆转录为cDNA；
4. 实时定量PCR反应；
5. 数据分析，计算PCR芯片中的各个Ct值，采用ΔΔCt方法比较基因的表达变化，并利用公司自主开发的数据分析软件进行比较。
基因列表
hsa_circ_0001445 | hsa_circ_0001189 | hsa_circ_0003222 | hsa_circ_0001283 |
hsa_circ_0002111 | hsa_circ_0002260 | hsa_circ_0003707 | hsa_circ_0001824 |
hsa_circ_0004458 | hsa_circ_0024108 | hsa_circ_0006022 | hsa_circ_0001875 |
hsa_circ_0004771 | hsa_circ_0036722 | hsa_circ_0006633 | hsa_circ_0004619 |
hsa_circ_0015278 | hsa_circ_0058106 | hsa_circ_0014717 | hsa_circ_0006054 |
hsa_circ_0021553 | hsa_circ_0058107 | hsa_circ_0047905 | hsa_circ_0006528 |
hsa_circ_0064557 | hsa_circ_0007874 | hsa_circ_0054971 | hsa_circ_0008717 |
hsa_circ_0067103 | hsa_circ_0000130 | hsa_circ_0057104 | hsa_circ_0008945 |
hsa_circ_0078738 | hsa_circ_0000497 | hsa_circ_0058766 | hsa_circ_0018293 |
hsa_circ_0079891 | hsa_circ_0001649 | hsa_circ_0060108 | hsa_circ_0005273 |
hsa_circ_0016347 | hsa_circ_0001727 | hsa_circ_0063561 | hsa_circ_0007158 |
hsa_circ_0013339 | hsa_circ_0003570 | hsa_circ_0069131 | hsa_circ_0041103 |
hsa_circ_0000284 | hsa_circ_0004018 | hsa_circ_0081146 | hsa_circ_0061265 |
hsa_circ_0023404 | hsa_circ_0005075 | hsa_circ_0084720 | hsa_circ_0082582 |
hsa_circ_0013958 | hsa_circ_0005986 | hsa_circ_0085553 | hsa_circ_0002768 |
hsa_circ_0003028 | hsa_circ_0000594 | hsa_circ_0089548 | hsa_circ_0075825 |
hsa_circ_0007915 | hsa_circ_0004383 | hsa_circ_0091742 | hsa_circ_0075828 |
hsa_circ_0013255 | hsa_circ_0000026 | hsa_circ_0138960 | hsa_circ_0075829 |
hsa_circ_0054345 | hsa_circ_0000140 | hsa_circ_0000069 | hsa_circ_0004136 |
hsa_circ_0061893 | hsa_circ_0000181 | hsa_circ_0020397 | hsa_circ_0017446 |
hsa_circ_0070963 | hsa_circ_0000190 | hsa_circ_0000098 | hsa_circ_0035381 |
hsa_circ_0071410 | hsa_circ_0000745 | hsa_circ_0000732 | hsa_circ_0058058 |
hsa_circ_0072088 | hsa_circ_0001895 | hsa_circ_0000893 |
|
hsa_circ_0072765 | hsa_circ_0003159 | hsa_circ_0000911 |
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（更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查询）
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)
Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)
Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.（IF6.065）
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