先进通量 News Letter 第二十五期 [2009-09-16]电子信息

      据9月11日的《科学》杂志报道说，如果美国有至少70%的人口很快获得2009A（H1N1）流感病毒疫苗的接种的话，那么这种疾病的扩散可被抑制到与轻微的季节性流感流行类似的地步。
      根据Yang Yang及其同僚披露，在最理想的情形下，儿童在不晚于本月的时候会首先接种疫苗。研究人员分析了最近的来自正在发生的疾病流行数据并为人们提供了最新的对该疾病所造成影响的估计。 根据在美国的上报病例，他们估计，该疾病在家庭中的传播速度使得这种2009H1N1病毒的传播能力处于过去的季节性和大流行性病毒株的传播能力范畴中的 高端。在这一画面中，儿童占据了一个特别重要的部分，即每一位受到感染的孩子在大约每3天的时间中具有感染2至3位其他孩子的潜在能力。
      研究人员应用一个电脑模型来模拟疫苗接种在各种不同的情况下将如何影响今年秋天在美国的疾病流行情况。如果能够很快获得疫苗的话，一种可使70%的人口得以接种的计划（以儿童为优先接种的对象）可有效地减轻该疾病的流行。

      英国研究人员10日报告说，与普通流感病毒相比，甲型H1N1流感病毒有更强的附着在细胞上的能力，能够直接与肺部深处的细胞结合并产生破坏作用。
      流感病毒需要先附着在细胞表面的受体分子上，才能进一步侵害细胞并引发感染。英国帝国理工学院的研究人员在试管中培养了86种不同的附着受体，以检测哪些受体是流感病毒的附着对象。结果发现，被研究的普通流感病毒只能附着在鼻腔、喉咙和其他上呼吸道细胞的受体上，而甲型流感病毒还可以附着在肺部深处细胞的受体上。
      研究人员说，甲型流感病毒的附着范围更广，说明它的传播能力更强。它能够直接附着在肺部深处的细胞上，这可以解释为何一小部分患者出现的肺部感染，要比普通流感病情恶化所引发的肺部感染严重得多。不过，甲型流感细胞附着在肺部细胞上的强度，要弱于该病毒附着在上呼吸道细胞上的强度，这一点有助于解释为何大部分甲型流感患者的症状都不严重。
      研究人员提醒说，将来一旦甲型流感病毒发生变异，变得对肺部细胞附着力更强，将会导致更多人出现严重的肺部感染。

      一个国际科研小组9日发布报告说，他们完成了对马铃薯晚疫病病菌的基因测序，这有助于找到对付这一病菌的新手段。晚疫病病菌曾导致历史上著名的爱尔兰大饥荒。
      马铃薯晚疫病病菌基因测序结果显示，与同类生物相比，该病菌有大得出奇的基因图谱，其中74％都是由重复出现的“转位子”组成。研究人员说，这是一个“疯狂”的比例，通常微生物基因图谱中有25％的“转位子”就已经很多了。“转位子”是具有特定功能的基因片段，它可以自我复制并在基因序列中四处移动，晚疫病病菌正是靠这些“转位子”的作用侵害马铃薯。研究人员认为，晚疫病病菌基因如此演化是为了保持一个庞大的“武器库”，便于迅速适应环境变化。
      一名马铃薯育种专家在评论上述成果时说，有时“好不容易费15年时间培育出一种有抵抗力的新品种，晚疫病病菌却只用几年就把它打败”，现在掌握了该病菌的基因图谱和“武器库”特点，将有助于研发能有效对付它的基因手段。

      “先天性全身终毛增多症(CGHT)”是一种极其罕见但遗传性很强的疾病。科学家还没有确定到底有多少人患有这种疾病，但是在中国的10多亿人口中至少有30例。
      北京协和医学院的研究人员搜寻到3个患有此病的家庭(包括16名患病成员)愿意参与该研究。研究人员扫描了这些患者的DNA，并将其与19个未患病的家庭成员进行对比。研究小组将搜寻范围缩小到17号染色体的一小段上，然后寻找一种叫作“拷贝数变异”的基因突变现象。在“拷贝数变异”现象中，大块大块的DNA存在重复或缺失。
      张学由此推测，基因突变改变了此处染色体结构，影响了附近基因的产生——附近的一种基因SOX9跟毛发的生长有关。据了解，没有这种基因的老鼠毛发会受损，即患上“秃头症”。张学称，如果CGHT患者的基因突变使17号染色体区域发生改变，就会导致毛囊干细胞中的SOX9蛋白产生过剩，引起过多的毛发生长。“但是所有这一切都纯粹是推测”，张学表示。以色列毛发疾病专家斯普雷彻认为,“该研究向治愈这种疑难疾病迈出了重要的第一步”。

      研究人员利用斑马鱼找到了一个基因，正是它使得这条巨大的镜鲤生有少而大的鳞片。
      研究人员追踪到一种被复制的基因——在这种基因的作用下能够繁殖出所谓的镜子鱼，这些鱼拥有巨大且能够反射光线的鳞片。美国纽约州锡拉丘兹大学的进化生物学家R. Craig Albertson指出：“这是有关这种假设的一个很有价值的证据，它完美地阐释了基因和基因组复制如何推动形态学的演化。”
      德国蒂宾根市马普学会发育生物学研究所的生物学家Matthew Harris和Nicholas Rohner，通过利用化学物质使斑马鱼的基因产生突变，进而开始了他们的实验。随后他们根据不寻常的特征筛查了发生突变的斑马鱼。其中的一个突变便是几乎全身没有鳞片，这不禁使人想起了镜鲤——为了容易打理而没有多少鳞片的一种鱼——的培育。研究人员最终将这一突变归结到一个名为纤维原细胞生长因子受体 1（fgfr1）的基因。

      华盛顿大学的研究人员设计的新算法对重复基因组序列拷贝数及其含量的计算被证明是有效的。
      Alkan说，"新算法，采用了新一代DNA测序技术，首次重复片段中可变拷贝数提供了精准的统计。"Kidd解释道，"它可以统计一个人是否含有 1个、2个、3个或者更多的基因拷贝。"许多标准基因组分析并没有包括人类基因组重复片段的分析，因为这些序列并不是唯一的。其实，"这种计算是非常困难的。"
      在该研究之前，也有科学家就此展开过研究，但是都没有计算出具体拷贝数。比如一些科学家研究结果表明了部分人可以通过增加基因拷贝数来抵抗HIV,但是关于拷贝数的增加数目却是一个未知数据。
      精确且系统的检测基因组片段拷贝数的能力是很重要的，特别是在个体基因组图谱的绘制和基因组如何塑造一个人的性格方面。接下来的挑战是确定片段重复在序列含量的变化和人类基因组中这些动态的、重要区域的结构。