微生物基因组测序
微生物生物基因组具有相对较小、重复序列较高、易于突变等特点,所以很必要对微生物进行全基因组测序。细菌de novo测序已取代传统方法成为研究细菌进化遗传机制,关键功能基因的重要工具。
目前,微生物基因组测序按测序精度大致可以分为框架图、精细图和完成图三类:完成图保证小于3gap,精细图保证小于50gap。
二、生物信息分析
1. 原始数据质量评估
2. 基因组拼装组装
3. KEGG、eggNOG、GO注释
4. 系统发育树
5. 基因家族分析
6. 亚细胞定位
三、结果展示
1. 数据库使用
数据库 | 网页链接 |
Refseq |
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eggNOG |
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