ISB与ETH苏黎世绘制人类蛋白质组图谱

西雅图--(美国商业资讯)--美国华盛顿州西雅图的系统生物学研究所(ISB)与瑞士苏黎世的瑞士联邦工学院(ETH 苏黎世)今天在澳大利亚悉尼召开的人类蛋白质组组织(HUPO)第9届世界年会上宣布，他们已通过质谱分析完成了人类蛋白质组完整图谱第一阶段的绘制。这些数据将作为ISB/ETH PeptideAtlas (www.peptideatlas.org) 计划的一部分，通过ISB/ETH SRMAtlas数据库(www.srmatlas.org) 供研究人员调阅。

人类基因组中，为蛋白质编码的基因目前已标明的有20,300个，据研究组报道，他们已为这每一个基因生成了"金标准"参照质谱谱系。该参照图谱将能使研究人员采用诸如选择反应监测(SRM)这样的靶向质谱技术来检测和定量任何生物学样本中的任何人类蛋白质，并能使他们更迅速更可靠地分析经典的 Discovery质谱技术所生成的数据。Robert Moritz, Ph.D. 副教授(ISB)、Leroy Hood, M.D., Ph.D. 教授(ISB)和 Ruedi Aebersold, Ph.D. 教授(ETH)汇同他们的团队和合作伙伴已进行了150,000多次SRM(选择反应监测)检测，包括每种蛋白质至少5个蛋白特异(蛋白质特有的)肽每个均检测一次。此外，他们还针对所有膜蛋白质和几乎所有可能包含碳水化合物(通过N糖基化位点结合)的蛋白质进行了SRM检测。他们还将检测扩展至人类群体发生率大于30%的基因DNA编码单字母改变(即单核苷酸多样性或简称SNP)所致突变中的大部分，这些突变导致氨基酸的改变。这些检测汇总起来组成了人类蛋白质组研究中迄今最全面的可供公众调阅的资源。

人类基因组计划最基础的贡献之一是使所有的生物学家能够调阅所有的人类基因；这一人类蛋白质组计划最终将同样能够使所有的生物学家调阅所有的人类蛋白质。

Robert Moritz为首的ISB团队已经与Ruedi Aebersold和他的ETH团队合作开发了工作流程。Ruedi Aebersold是ISB的联合创始人，他也是瑞士联邦工学院(ETH 苏黎世)的系统生物学教授，与ISB主席Lee Hood 共同担任SRM图谱计划的联合主要研究者。Aebersold博士是创建公众资源以支持人类蛋白质组质谱研究的先驱。

依据2009年美国恢复和再投资法案，美国国立卫生研究院下属国立人类基因组研究所为ISB提供了270万美元的直接资助，以支持这项计划。ERC 蛋白组学高级经费v3.o 233226号资助经费为ETH提供了为期5年总计240万欧元的计划支持。

该计划还得到了Agilent Technologies公司和AB/SCIEX 公司这2家领先技术公司的支持，他们分别为ISB和 ETH 苏黎世提供仪器支持，Thermo-Fisher公司和JPT公司提供肽耗材，生物耗材公司OriGene公司提供纯化的人类蛋白质。

完整的人类蛋白质组图谱和S/MRM图谱将为研究人员检测和定量任何生物学样本中的任何人类蛋白质提供一整套信息和检测方法。这一重大发展将大幅提高蛋白组学研究的可重复性和可靠性，从而显著加速基础研究和转化研究。通过发掘Aebersold教授于2003年绘制的10,000种已知人类蛋白质 ISB肽图谱，并将这些信息补充到ISB研究人员及其合作者采用生物信息学分析法开发的其余人类蛋白质的肽预测算法中，该团队已经能够在没有物理数据的情况下推衍出供SRM用途的最佳蛋白特异肽。全套图谱包括每种蛋白质的至少5个肽。此外，这些工具还能够使研究人员挑选最佳的肽转换，以便在复杂的混合物中独一无二地辨识这些肽。

图谱将通过SRMAtlas网站发布，该计划的所有信息将公开。

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