中国科学家继Science后 再获基因组研究突破

来自中国热带农业科学院，深圳华大基因研究院等处的研究人员宣布了香蕉枯萎病菌1、4号小种(FocR1、FocTR4)全基因组测序已经完成，这是在国际上率先破译Foc R1、Foc TR4 基因组的遗传密码。

上个月深圳华大基因研究院，西南大学等处合作发表了“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”的研究成果，这一研究成果共获得了40个家蚕突变品系和中国野桑蚕的全基因组序列,是多细胞真核生物大规模重测序研究的首次报道,共获得632.5亿对碱基序列(63.25Gb),覆盖了99.8%的基因组区域；绘制完成了世界上第一张基因组水平上的蚕类单碱基遗传变异图谱,是世界上首次报道的昆虫基因组变异图；从全基因组水平上揭示了家蚕的起源进化；发现了驯化对家蚕生物学影响的基因组印记。

自1910年巴拿马香蕉枯萎病大爆发至今，已给南美、非洲和亚洲的各主要香蕉种植国造成惨重损失。香蕉枯萎病菌有4个生理小种,对香蕉危害性最大的是1号和4号小种,1号小种危害粉蕉类品种,不危害巴西蕉,4号小种几乎危害所有类型的香蕉品种。在我国分布并对香蕉造成巨大危害的是Foc R1 和Foc TR4 这2个小种。由于香蕉枯萎病是土传维管束病害,病原菌从根、茎基部侵入后在维管束中侵染蔓延,一般的化学药剂难以奏效,至今没有十分有效的化学药剂防治。同时,由于Foc遗传背景复杂,长期以来对Foc的致病分子机理不清,至今尚未培育出真正抗FocTR4的香蕉品种。因此,对香蕉枯萎病菌Foc R1、Foc TR4 进行全基因组测序,可为这2个小种的致病机理研究提供重要基础,进而为香蕉抗枯萎病育种提供理论指导,为防治药剂的筛选提供新的靶标,从而最终控制香蕉枯萎病的危害。

中国热带农业科学院环境与植物保护研究所和热带生物技术研究所联合中国科学院北京基因组研究所深圳华大基因科技有限公司于2008年11月正式启动了“香蕉枯萎病菌FocR1和FocTR4全基因组测序计划”。在目前取得成果的基础上，课题组下一步将开展Foc致病功能基因组研究,阐明FocR1和FocTR4的致病机理及Foc小种的变异机制。