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反向long noncoding RNA(lncRNA)靶基因预测服务
反向long noncoding RNA(lncRNA)靶基因预测服务
  • 反向long noncoding RNA(lncRNA)靶基因预测服务

反向long noncoding RNA(lncRNA)靶基因预测服务

产品报价:询价

更新时间:2014/1/7 11:00:05

地:上海

牌:BIOTREE

号:定制

厂商性质: 生产型,服务型,

公司名称: 上海阿趣生物科技有限公司

产品关键词:

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阿趣生物科技有限公司 : (18721553101) (021-61531195)

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服务内容:

与常规的从lncRNA出发预测靶基因不同,反向long noncoding RNA(lncRNA)靶基因预测是从感兴趣的已知基因开始(例如p53COX-2等与肿瘤等密切相关的基因,这些基因可以来自芯片分析结果、NLP结果或客户给定的任何基因列表),利用我们的long noncoding RNA(lncRNA)数据库和靶基因预测软件pipeline,找到潜在的调节这些基因的lncRNA

研究方法:

我们的服务提供:

1.        获取感兴趣的基因集合

这些基因可以来自芯片分析结果、NLP结果或客户给定的任何基因列表。如p53COX-2

2.        建立lncRNA数据库

我们通过整合已知所有lncRNA数据库,形成一个全面的包含所有lncRNA序列的数据库

3.        细胞组织特异高表达lncRNA的鉴定(可选)

根据客户提供的细胞组织信息,我们搜索已有的tiling芯片以及新一代测序得到的转录组信息,从全基因组已知lncRNA的中鉴定高表达的lncRNA

4.        cis靶基因预测

Cis作用[5]lncRNA的一种靶基因作用方式。我们利用基因组注释和基因组浏览器鉴定lncRNA的可能的靶基因。一般在启动子区域同向转录的靶基因一般是促进表达作用,反向为抑制。而在3’-UTR区域时,部分情况下反向也为促进表达,见[14]

5.        trans靶基因预测

trans作用是lncRNA的另一种靶基因作用方式。我们利用RNAplexhttp://www.tbi.univie.ac.at/~htafer/)等鉴定lncRNA的可能的靶基因。

上海阿趣生物科技有限公司

| 第13

手机:18721553101

联系人:阿趣生物科技有限公司

电话:021-61531195

传真:

QQ:2850277929

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