为加强“院校合作、所系合作”精神，广泛开展了科学研究和研究生培养等方面的合作，自2007年4月开始，中国化学研究所在中国科技大学开设了“化学前沿最新进展”系列讲座，每周一次，每次2个学时，到目前为止，已经举行了9次，受到中国科技大学研究生和高年级本科生的广泛欢迎。在每次讲座的筹备过程中，化学与材料科学学院都为讲座进行全面细致的安排，中国科技大学党委书记郭传杰曾专门来到讲座现场看望化学所的授课教师。

    中国科技大学化学与材料科学学院是国内化学领域最好的学院之一，培养出了众多优秀的化学和材料科学人才。中科院化学所是以开展基础研究为主，有重点地开展国家急需的、有重大战略目标的高新技术创新研究，并与高新技术应用和转化工作相协调发展的多学科、综合性研究所，已经发展成为在国际上有重要影响、在国内居于化学学科领先地位的国立研究机构，发表SCI论文及SCI论文被引用数名列全国科研机构前茅，在2006年全国学科评估化学学科中获得最高分。

    近年来，化学所与高校一直在探索“所校合作、协同发展”的创新道路，已经与武汉大学、北京大学、中国科技大学、南京大学、湘潭大学等高校建立了紧密的合作关系，在共同培养高素质人才方面取得了良好的效果，促进了高校和研究所之间的广泛交流与合作，一定程度上实现了教育资源的共享。